Table 4 Amino acid substitutions in the VP1/VP2 sequences of PPV1 isolates from wild boars relative to the NADL-2 vaccine strain. Dashes indicate the identity of amino acids
From: Distribution and phylogenetic analysis of porcine parvoviruses in the wild boar population of Russia
PPV1 isolate | Position in the amino acid sequence of PPV1 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
VP1 | VP1/VP2 | ||||||||||||||||
29 | 82 | 98 | 114 | 163 13 | 195 45 | 232 82 | 365 215 | 378 228 | 470 320 | 520 370 | 528 378 | 533 383 | 564 414 | 569 419 | 586 436 | 715 565 | |
NADL2 | Glu | His | Thr | Arg | Ala | Thr | Arg | Ile | Gln | Ile | Asn | Asp | His | Ala | Glu | Ser | Arg |
Kresse | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | - | - | - | Gly | Gln | - | - | Pro | Lys |
27a | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
MosWB1 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
MosWB3 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
MosWB9 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
MosWB27 | - | - | - | Lys | - | Ser | - | Thr | - | Thr | Asp | Gly | Gln | - | - | Pro | Lys |
MosWB30 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
TvWB32 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | - | - | - | Gly | Gln | Ser | - | Thr | Lys |
TvWB33 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
TvWB34 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | - | - | - | Gly | Gln | Ser | - | Thr | Lys |
TvWB42 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
TvWB54 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | - | - | - | Gly | Gln | Ser | - | Thr | Lys |
BelWB57 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | - | - | - | Gly | Gln | Ser | - | Thr | Lys |
BelWB61 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
BelWB68 | - | Tyr | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
BelWB70 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | - | - | - | Gly | Gln | - | - | Ala | Lys |
TvWB81 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
TvWB89 | - | - | - | - | - | Ser | - | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |
MosWB91 | Lys | - | Ile | - | Thr | Ser | Lys | Thr | Glu | - | - | Gly | Gln | Ser | Gln | Thr | Lys |