Table 5 Conformational B-cell epitopes analysis of V3
No. | Residues | No. of residues | Score |
|---|---|---|---|
1 | A: C400, A: P401, A: S402, A: G403, A: F404 | 5 | 0.922 |
2 | A: K394, A: S395, A: D396, A: E397, A: K398, A: F399 | 6 | 0.844 |
3 | A: R405, A: S406, A: N407, A: A408, A: S409, A: S410, A: K411 | 7 | 0.827 |
4 | A: M1, A: A2, A: Q3, A: V4, A: I5, A: N6, A: T7, A: N8, A: S9, A: L10, A: S11, A: L12, A: L13, A: T14, A: Q15, A: N16, A: N17, A: L18, A: N19, A: K20, A: S21, A: Q22, A: S23, A: A24, A: L25, A: G26, A: T27, A: A28, A: I29, A: E30, A: R31, A: L32, A: S33, A: S34, A: G35, A: L36, A: R37, A: I38, A: N39, A: S40, A: A41, A: K42, A: D43, A: D44, A: D517, A: S518, A: D519, A: Y520, A: A521, A: T522, A: E523, A: V524, A: S525, A: N526, A: M527, A: S528, A: R529, A: A530, A: Q531, A: I532, A: L533, A: Q534, A: Q535, A: A536, A: G537, A: T538, A: S539, A: V540, A: L541, A: A542, A: Q543, A: A544, A: N545, A: Q546, A: V547, A: P548, A: Q549, A: N550, A: V551, A: L552, A: S553, A: L554, A: L555, A: R556 | 84 | 0.748 |
5 | A: G80, A: A81, A: N83, A: E84, A: I85, A: N86, A: N87, A: N88, A: L89, A: Q90, A: R91, A: V92, A: R93, A: E94, A: L95, A: A96, A: V97, A: Q98, A: S99, A: A100, A: N101, A: S102, A: T103, A: N104, A: S105, A: Q106, A: S107, A: D108, A: L109, A: D110, A: S111, A: I112, A: Q113, A: A114, A: E115, A: I116, A: Q117, A: Q118, A: R119, A: L120, A: N121, A: E122, A: I123, A: D124, A: R125, A: V126, A: S127, A: G128, A: Q129, A: T130, A: K136, A: L138, A: C453, A: D454, A: L455, A: K456, A: H457, A: F458, A: E459, A: C460, A: G461, A: G462, A: T463, A: E464, A: E465, A: A466, A: A467, A: A468, A: K469, A: L470, A: Q471, A: K472, A: I473, A: D474, A: A476, A: L477 | 76 | 0.625 |
6 | A: N232, A: D233, A: P234, A: T235, A: D236, A: G237, A: I238, A: L239, A: G240, A: G241, A: P242, A: G243, A: P244, A: G245, A: R246, A: N247, A: A248, A: L249, A: A251, A: S252, A: N253, A: L254, A: A255, A: T256, A: S257, A: S258, A: Q259, A: Q260, A: G261, A: P262, A: G263, A: P264, A: G265, A: N266, A: D267, A: S268, A: V269, A: H270, A: Y271, A: G272, A: Q273, A: T274, A: G380, A: F381, A: E382, A: L383, A: H384, A: E385, A: N386, A: A387, A: K388, A: N389, A: C390, A: T391, A: S392, A: K393, A: K412, A: R413, A: V414, A: T415, A: D423, A: S426, A: D427, A: K428, A: K429, A: K430 | 66 | 0.623 |