In-silico analysis of deleterious non-synonymous SNPs in the human AVPR1a gene linked to autism

BMC Genomics

Table 3 Prediction of disease-associated SNPs by Meta-SNP, SNAP, PhD-SNP, and SNPs & GO

Variant ID	Nucleotides	AA Variations	Meta-SNP		SNAP		PhD-SNP		SNPs & GO
rs1260022270	C/T	R85H	0.659	Di	0.590	Di	4	Di	7	Di
rs1267958616	C/T	D202 N	0.481	Ne	0.720	Di	5	Di	3	Di
rs1321994497	T/C	E54G	0.766	Di	0.740	Di	3	Ne	9	Di
rs1325662981	T/G	H92P	0.900	Di	0.775	Di	5	Di	10	Di
rs1337643184	C/A	D148Y	0.932	Di	0.840	Di	8	Di	9	Di
rs1338176647	A/C	C203G	0.905	Di	0.850	Di	5	Di	9	Di
rs1369668995	C/T	V297M	0.809	Di	0.755	Di	1	Ne	9	Di
rs1377891669	T/A	D148 V	0.928	Di	0.815	Di	8	Di	10	Di
rs1417441306	C/T	S182 N	0.727	Di	0.735	Di	3	Di	9	Di
rs1424280726	T/A	Q108L	0.568	Di	0.530	Di	5	Di	9	Di
rs1440280008	G/A	R149 C	0.911	Di	0.805	Di	5	Di	9	Di
rs1449556252	C/A	G212 V	0.742	Di	0.525	Di	4	Di	8	Di
rs369710823	A/G	M145 T	0.773	Di	0.590	Di	4	Di	9	Di
rs376518166	C/T	G212S	0.653	Di	0.310	Ne	3	Di	6	Di
rs745458336	T/G	Y140S	0.841	Di	0.705	Di	6	Di	9	Di
rs748572296	A/C	F207 V	0.721	Di	0.690	Di	3	Di	9	Di
rs754449459	T/A	Q108H	0.649	Di	0.550	Di	2	Di	8	Di
rs758567125	A/C	W219G	0.839	Di	0.825	Di	6	Di	9	Di
rs767540299	G/A	R284 W	0.751	Di	0.695	Di	0	Di	6	Di
rs772227542	G/A	L93 F	0.765	Di	0.710	Di	2	Ne	7	Di
rs773269527	G/C	P156R	0.900	Di	0.815	Di	0	Di	9	Di
rs776488571	A/C	F136 C	0.825	Di	0.615	Di	5	Di	9	Di
rs780705756	G/A	P107L	0.547	Di	0.640	Di	7	Di	8	Di

ISSN: 1471-2164